De acordo com a Associação Brasileira Desportiva, em 2016, o clube disputou 11 campeonatos da Série B, sendo os jogos 3️⃣ que garantiram ao Botafogo o acesso para a Série A do Campeonato Brasileiro de Futebol.
Em 2015, com a aquisição do 3️⃣ atacante Zé Roberto e bwin 94.6 transferência para o Palmeiras, o clube viveu uma forte fase de conquistas, tendo sido finalista 3️⃣ em duas edições da Série B e alcançado a inédita final em 2004, em São Januário, quando chegou ao, vencendo 3️⃣ ambos os turnos.
No ano seguinte, o clube revelou o atacante Luís Fabiano como novo
reforço para a equipe.
Na Copa do Brasil 3️⃣ de 2015, foi derrotado por 3 a 2 por 1 a, mas conquistou seu primeiro título, sendo campeão paulista.